
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物体 为其提供 TMT蛋白酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研究探讨数据
科学研究技术人员科学探究跟随着速冻时光调长牛肉片片的硬性、持水、汤色、徘徊铁量、ROS、脂质过硫化物、MDA、GSH和GPX4横向来评估方法脂肪阻止人体细胞核的铁消亡模式。报告展现,速冻时光调长后,牛肉片片的硬性在第8天和第6天可观回落;持水作用拉低;颜色等等变深,得不到亮光,鲜网红转为暗网红。于此,徘徊铁、亲水性氧和MDA的量可观提升,人体细胞核凋亡率可观偏高。 科研相关人员去除各种食品冷藏周期的手臂肌肉组织合格品的球营养物质,并且去SDS-PAGE定量定量分析,球营养物质条带在各种晚唐时期地理分布竖直且同类性(图1a)。给出球血清酶在各种合格品中的传达状态,定量定量分析发展相同组合格品的中个数比较敏感于相同平行(图1b),就说明手臂肌肉组织合格品球营养物质兼具优质的组内同类性性和组间区别性。 脂肪酸质组学共判定出1996种脂肪酸质。以B0为较组,建立B1、B2、B4和B6中的脂肪酸展开距离表明进行研究分析,共判定到377个DEPs。将火山图交互,并可根据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05的两个规范标准进行研究分析DEP。报告单如图所示1c-f如图所示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分发型别判定出22、33、73和140个DEPs,在当中分发型别调整6、11、32和87个,调整16、22、41和56个。聚类算法工艺考核了有所不同食品冷藏周期脂肪聚集中脂肪酸质的表明,报告单展现脂肪脂肪酸表明距离随之贮藏精力的增高而增高(图1g)。
图1| 差异冷藏箱精力的脂肪样品管理蛋清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不一速冻准确时间的健身肌肉土样不同蛋清剖析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁生亡淀粉酶肽的PRM参考值探讨(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 系统设计KEGG聚集的差异传达核蛋白的铁身故逻辑(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱动物提供了TMT化学发光法核高蛋白质组学高系统业务,拜谱生态学已研发培训到位并树立了进一步优化稳定的转录组学、核蛋白质组学、产生组学、几组学结合食品高系统业务网络体系,欢迎致电咨询!
参阅医学文献:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.