
近日,深圳医科师范大学一是其他醫院王学浩科学院院士开发团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶点人体脂肪细胞代谢检测分析服务。
用英文怎么说标题文字:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文翻译主题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
客院校:南京医科大学
探讨原料:细胞
拜谱出示工作:转录组测序+蛋清互作组+靶点卡路里新陈代谢组
技术水平自驾线路:
调查后果
01、YBX1被技术鉴定为HCC中糖酵解的根本染色体
本的研究采集器HCC肿癌样表(n=7)的单神经元RNA测序数据报告表格集做出了解,看见糖酵解生物主要网络化在肿癌神经元中,hdWGCNA了解自动识别出9个DNA方案(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的活了解敲定YBX1为独有活可能性基本要素(图1H)。更加一个脚印联系IHC、WB实验设计和肿癌团队与毗邻非肿癌团队的地方转录组学数据报告表格集声明YBX1是肝神经元癌的治疗的潜在性靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被判定为改善HCC神经元糖酵解的的关键原因
02、YBX1催进HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物人体脂肪细胞代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1加快HCC中的有氧糖酵解和增值
03、OGT与YBX1搭配并提高网站YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,球蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1综合并有助于YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化减弱其磷碱化,若想促使其核转位
进一大步检侧YBX1的O-GlcNAc糖基化可不可以决定其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC肿瘤细胞核中或用OGT调控剂OSMI-1解决,YBX1淀粉酶质技术相关系数下降,YBX1磷硝化作用相关系数极大减少(图4A-C)。IP实验操作凸显,在不同的Flag-YBX1底物技术下,YBX1-WT的磷硝化作用技术相关系数低于YBX1-T57A,表面磷硝化作用的增高这样不但只是担心会高的YBX1淀粉酶质表述(图4D)。分离法了核和质成分挖掘TMG解决的HCC肿瘤细胞核中YBX1核表述的提升(图4E-F),进一大步挖掘YBX1磷硝化作用的至关重要上下调整成分是AKT(图4G-I)。等挖掘讲求O-GlcNAc糖基化进行提高网站其磷硝化作用来不断增强YBX1淀粉酶质稳定可靠性并提高网站核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 表达利于于其进的一步发生了磷酸性反应表达并都可以增强其核转位
05、YBX1使得PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1加快PKM2转录
06、YBX1 是可以提升 组血清乳过酸突显标准
研究方案显示YBX1敲低同质性调低了核蛋白酶质乳硝化为用,特别是是H3K18乳硝化为用(图6A-C)。糖酵解压药品2-DG的科学试验灵魂出现了糖酵解与组核蛋白酶乳硝化为用的真接绑定qq,压制糖酵解可同质性调低了H3K18la水准(图6D)。PKM2过呈现方式可逆转转YBX1敲低所至的H3K18la骤降,到外源乳酸办理这不仅提升自己H3K18la,还伴有YBX1呈现方式上涨,提示卡出现正在向反应(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR灵魂出现,H3K18la借助含有于YBX1重新启动子真接推进其转录,该步骤受O-GlcNAc糖基化改善(图6H-J),并显示P300 上涨是YBX1增加H3K18乳酰化为用的原则(图6K-L)。
图6.YBX1改善H3K18乳酸性反应掩盖情况
好文章个人心得体会
在此项论述中新闻稿件了YBX1在HCC中高描述,或者与糖酵解迷切涉及。YBX1在T57处被O-GlcNAc淡化,若想保持稳定球高核蛋白并加入其描述。在这种淡化还带动YBX1在T57处的磷硝化作用,带动其核易位。故而,一项的时候怎强了糖酵解涉及DNA的转录并刺激到乳酸的行成。除此以外,YBX1解锁P300的转录,因此带动组球核蛋白的乳硝化作用,特别的是H3K18la,H3K18乳硝化作用正向着监测YBX1DNA转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传病正反面馈环机能图
拜谱总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱动物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向治疗人体脂肪新陈代谢组技术服务,拜谱海洋生物建立了完善成熟的转录组学、蛋白酶组学、反译后呈现组学、细胞代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
规范文献综述
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.