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网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿装置的最易见的急病其一。肾组织开展中CaOx结晶过饱和累积会存在肾小管肿瘤细胞挫裂伤和凋亡,要点在于存在肾结石的存在。短链皮下人体脂肪酸由可以使肠胃内好氧池结核杆菌发酵法膳食结构氯纶存在,实际上在边缘可以使肠胃第一道防线中起功效,另外在装置的横向上也起要点功效。至少,丁酸是最多样化的短链皮下人体脂肪酸,还具有免役可抑制和免役可抑制功效,本一起探讨一起探讨丁酸对CaOx肾结石的功效下列不属于内在的靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山醫院泌尿美容外科吴忠传授、周子健研究生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠先生、周子健医学博士在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱菌物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了在线临床药理学产品,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

原创文章公司名称:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 消费者的单位:华山专科医院 学习关键字:大鼠、HK-2神经元 分组名称信心:比较组(Con)、实体模型组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱给予技木:网药学学在线检测

想法流程步骤图

研究分析的结果

理论研发考生一方面创造出一个大鼠模板,确认生理问题血生化评价指标和企业病理学学染料等理论研发策略显示丁酸应该增多CaOx模板大鼠肾CaOx晶胞的转变成和损坏,优化CaOx模板大鼠的宫颈炎症损坏和空气氧化物化合物的无限展示。除外,丁酸还可治理和改善草酸促进的HK-2人体细胞核损坏、空气氧化物应激反应和人体细胞核凋亡。 为探索性丁酸设计设计和靶表观遗传wifi网路,探索成员从PubChem抓取丁酸和丁酸酯的二维和二维设计设计(图1A)。借助PharmMapper统计数据信息显示库和Uniprot统计数据信息显示库外理后共需求出115个丁酸靶表观遗传供进1步讲解。将表观遗传索引把手机通讯录STRING统计数据信息显示库,来进行PPIwifi网路讲解。Cytoscape已给出了排列顺序的前20的核心靶表观遗传的图解wifi网路图,分为CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这个核心表观遗传与wifi网路中的另一表观遗传均情况出务必的相应性,代表这个表观遗传应该充分调动着协作想法。GO和KEGG讲解反映了丁酸核心表观遗传的相应经过和菌物技术学基本功能(图1C)。核心表观遗传最一般的与类固醇雄抗生素回应、钝化想法应激性想法回应、抗逆性氧上皮细胞对类固醇雄抗生素影响的想法或者对酸碱性无机化学杂质的想法光于。笔者认为综上,这个核心表观遗传最一般的直接参与了钝化想法应激性想法和对抗逆性氧的菌物技术想法过程中 ,是肾结石确立管理机制中至关极为首要的经过,这说明丁酸应该在肾结石中充分调动极为首要想法。

图1| 丁酸组成部分与靶基因遗传网路研究分析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进步探寻丁酸对CaOx肾结石更何况切靶什么是DNA遗传,探讨员工充分利用GEO数值库对GSE73680中健康生活相较比较与CaOx肾结石客户的什么是DNA遗传距离做出了探讨。相较比较组与CaOx结石客户的更为明显性距离表答方法什么是DNA遗传(DEGs)肿瘤筛查标准化为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共挑选到3783个什么是DNA遗传有更为明显转变,但其中3379个(89.4%)什么是DNA遗传表答方法调涨,404个(10.6%)什么是DNA遗传表答方法变动(图2A)。对DEGs做出聚类分析介绍介绍,热图界面显示了前10个被选中DEGs的二维分类聚类分析介绍本质特征(图2B)。随即,探讨员工对其进行GeneCards数值库机器检验了370个将与CaOx肾结石相应的什么是DNA遗传,排民前20位的预測什么是DNA遗传简述相应性评分表如同2C一样。想要查找丁酸医疗CaOx肾结石的关键的靶点,探讨员工将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石相应什么是DNA遗传处里取得好几回个Venn图。结果,CYP2C9被确实为丁酸引响CaOx肾结石的不确定靶点(图2D)。最后,探讨员工还做出了丁酸与CYP2C9的大分子接入,CYP2C9的5个安基酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸双方用途,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在回收利用微信网络药理学学精准预测CYP2C9是丁酸干扰CaOx肾结石的靶DNA后,理论研究拜谱生物还经过体细胞核试验表明了CYP2C9可变低草酸诱发的HK-2体细胞核的ROS的水平、炎症病变拉伤和凋亡。

图2| 许多据库联办概述预计CYP2C9是丁酸的功效于CaOx肾结石的靶遗传基因

理论研究可是

本的研究最先挖掘丁酸在身体之外和身体均能控制CaOx肾结石实体模型的硫化应激性性和疾病问题,陆陆续续进行系统药学学学淘汰赢得丁酸不良影响CaOx肾结石的内在靶点——CYP2C9,最后一个进行神经细胞膜实验性证明CYP2C9在草酸盐引发的HK-2神经细胞膜ROS标准、疾病问题和凋亡。这个挖掘呈现丁酸可能性进行控制CYP2C9来控制CaOx肾结石的硫化应激性性,得到缓解疾病问题。这一项的过程 中拜谱微生物工程带来了了系统药学学学的技术工艺开发保障,前者拜谱微生物工程可增加成熟的成熟的的基因遗传组学、蛋清质组学、分解组学等多个学产品设备及的技术工艺开发保障,受欢迎垂询在线咨询! 分类期刊论文:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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