代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
的基本的检查是否成分亲子鉴别：排泄组学方法就能够对中中草药材中的检查是否上的基本的检查是否成分参与全面性讲解，亲子鉴别出中草药材中的催化抗逆性的基本的检查是否成分。譬如，回收利用立于质谱（MS）的排泄组学方法，能亲子鉴别出人叁中的人叁皂苷等催化抗逆性的基本的检查是否成分。各种方法还能判别中医和非中医一部分的检查是否上标识物，为中中草药材的水平控住提供了理论依据。
安全性能保持：使用分解细胞代谢率组学办法，还不错对西药配方配方的安全性能对其进行评价指标和保持。譬如，采用常绿绿植分解细胞代谢率组学介绍，还不错开发管理对於类痛风性骨肩周炎的西药配方配方材料表的安全性能标签的按量办法。不仅如此，分解细胞代谢率组学还还不错设别系统西药配方配方中的致毒材料表举例致毒原则，如使用UPLC-Q-TOF-MS科学研究，区别的不同乌头常绿绿植的化学工业材料表，并设别系统具镇疼活力性和亚急性致毒的生物制品碱。
2. 中药药效机制研究
意义靶点认别：细胞代谢组学枝术不错有所帮助认别药材灵活性含量的氧分子靶点。假如，论述发现雷公藤红素可完成的调节Treg/TH1和Treg/Th17稳定平衡、抑制NF-κB环路等新机制激发免疫抑制意义。
角色考核系统解读：排泄率组学技巧还就可以阐明西药制疗疾患的角色考核系统。列如 ，论述挖掘青蒿素耐药肺结核与疟原虫的线粒体排泄率优化有关系，非靶向药物排泄率组学阐明了与该具体步骤有关的排泄率物发生影响。不仅，排泄率组学还就可以凭借定性分析排泄率物的发生影响，论述西药复方的角色考核系统。
3. 中药安全性评价
毒副作用长效机能探究：产生组学科技可能用来探究西药的毒副作用长效机能。举例，按照产生组学和16S rDNA测序的合并分折，阐明了清益汤对病情比较重的时候呼吸功能衰竭膀胱胰腺炎有关心呼吸功能衰竭膀胱肺损害的保护好长效机能，并决定了铁处变不惊、地域差异产菌物和微菌物菌群之前的关心。
防护性估评：代谢转化组学技術还可不可以用来中药才配方的防护性估评，辨识内在的的渗透性化学物质和渗透性靶点，最终得以为中药才配方的防护安全使用出示物理学按照。
4. 中医证候研究
证候有关分解细胞产生物工程定性分析：分解细胞产生组学能力就可以主要用于科研方法与中医学药学证候有关的内源性分解细胞产生物工程变迁，辅助制作中医学药学证候的的诊断和介入。举个例子，能够分解细胞产生组学科研，已在冠烦扰之处朋友中鉴定会出与痰瘀证随和阴两虚证有关的生物工程标志牌物。
证候介入探讨：新陈有组学系统还可采用探讨中药才对中医针灸证候的介入疗效。举例，利用新陈有组学系统及聚类探讨探讨法，显示“黄芪-茯苓-泽泻”等相互关系中成药选型适采用肾病标准化征的新组方中成药，才可以对四种肾病标准化征关联的生物学圆形标志物有关系。
5. 多组学技术整合应用
两组学资源资源优化配置资源：分泌组学与别组学系统（如人类基因组学、转录组学、淀粉酶质组学等）的资源资源优化配置资源利用，为中草药探索提拱了一大个多因素的深入分析架构图。本身资源资源优化配置资源利用不挖深了我对中草药的成分在分子式层级上对女性身体生理学和病症阶段的不良影响，有时为表明中草药的效用系统和药用价值材料基本知识提拱了强力量的手段。
急病治愈逻辑：多个学技術能能使用在的研究中西药治愈急病的碳原子逻辑。比如，根据蛋白质酶质组学和排泄组学的整合软件，表明了与中医理论区分的膝骨环节骨性骨环节炎相互之间有关的差别表达爱蛋白质酶和排泄信号通路。
细胞代谢组学的技术在中葯研究探讨中的应用软件，为中葯的中国智能化和精淮医院提高了最重要的生物学使用，促使推进中葯的标淮化和国家化转型。